1. Pode ser usado como um intermediário farmacêutico, pesticida, corante e outros intermediários de síntese orgânica. It can be used to synthesize 2-amino-pyrimidine, 2-amino-6-methylpyrimidine, 2-amino-4,6-dimethylpyrimidine, and is an intermediate for the manufacture of sulfonamide drugs such as sulfametoxazol, sulfametoxazol e sulfametoxazol.
2. O cloridrato de guanidina (ou nitrato de guanidina) reage com o cianoacetato de etila para o formulário 2, 4- diamino -6- hidroxipirimidina, que é usada para sintetizar o medicamento anti -anemia. Também pode ser usado como um agente antiestático para fibras sintéticas.
3. Também pode ser usado como um agente desnaturador de proteínas.
4. Como um forte agente desnaturador no experimento de extrair o RNA total das células. A solução de cloridrato de guanidina pode dissolver proteínas, causando danos estruturais às células e estrutura secundária das proteínas nucleares, que se dissociam dos ácidos nucleicos. Além disso, as RNases podem ser inativadas pela redução de agentes como o cloridrato de guanidina.